Югио! Тёмная сторона измерений

Прошло шесть месяцев. Юги и ребята уже в третьем классе, и вместо дуэлей на переменах теперь разговоры о том, кем быть после школы. Обычная жизнь, только Дзюн всё никак не угомонится и тащит всех на очередной турнир. А где-то в башне Кайба корпит над осколками Головоломки тысячелетия. Он хочет вернуть того, кто ушёл. Любой ценой. Параллельно корпорация обкатывает виртуальную систему дуэлей, которая может переписать правила игры целиком.

И тут всё идёт наперекосяк. Появляется человек по имени Аигами. Кто он, чего ему надо, почему он лезет в дела с Головоломкой, никто не понимает. Он играет по своим правилам и путает карты всем, включая Кайбу.

Юги оказывается перед выбором: отпустить прошлое или держаться за него до конца. Кайба, кажется, вообще не заметил, что живёт в настоящем. Оба идут к развязке, но ответы у них разные. А что будет, если Головоломку действительно соберут?